El Programa de Cooperación internacional apoya a las comisiones permanentes y las comisiones especiales en el establecimiento de alianzas con Agencias de Desarrollo y Organismos Internacionales, con un enfoque particular el el area del Intercambio del Conocimiento y la Cooperacón Tecnica.

Entre las Organizaciones con las que el Consejo ha establecido contacto y/o alianzas destacan:

• Banco Mundial
• Corporación Financiera Internacional (IFC)
• Organizacion para la cooperación y el desarrollo económico (OCDE)
• Naciones Unidas
  • PNUD
  • UNICEF
  • UNIDO
  • UN Global Compact Network
• Organización de los Estados Americanos
• Agencia para el Desarrollo de Los Estados Unidos (USAID)
• Earth Institute
• William & Melinda Gates Foundation
• Fondo mundial de lucha contra el SIDA, la tuberculosis y la malaria.

Para el mejor funcionamiento del programa el Consejo ha establecido un Consejo Asesor Internacional conformado por expertos internacionales que apoya las actividades del Consejo.